O programa do MBA Catho Online se divide em 3 partes: 20 matérias, Business Game e Plano de Negócios. A avaliação de cada uma das 20 matérias será feita através de um teste com 20 questões de múltipla escolha. Se o aluno obtiver média igual ou superior a 7,5, esta será a sua avaliação na matéria. Se o aluno não obtiver média igual ou superior a 7,5 nesta prova, poderá fazer uma segunda tentativa. O resultado da matéria neste caso será a média aritmética das 2 provas. O Business Game não terá avaliação, no entanto a participação do aluno é um pré-requisito indispensável para obtenção do certificado. O Plano de Negócios será avaliado pelo orientador que atribuirá uma nota para o trabalho desenvolvido. A média final do MBA será calculada utilizando a seguinte ponderação: 80% média ponderada da avaliação das 20 matérias e 20% avaliação do Plano de Negócios. Para obter o certificado de conclusão do MBA a média final, calculada segundo a ponderação acima, deverá ser igual ou superior a 7,5. Alunos cuja média final for menor que 7,5, mas realizarem todas as matérias, participarem do Business Game e desenvolverem o Plano de Negócios, receberão um certificado de participação.